青岛解锁龙胆石斑基因精细图谱 此前已绘制牡蛎、扇贝、花鲈等五大养殖海鲜的基因图谱
半岛记者韩小伟报道
本报7月3日讯7月3日,半岛记者获悉,近日黄海水产研究所等单位联合完成鞍带石斑鱼基因组精细图谱绘制。近年来青岛在水产养殖领域的基因研究走在了全国前列,在此之前,岛城科研院所已完成了牡蛎、半滑舌鳎、褐牙鲆、扇贝、花鲈五大养殖海鲜的基因图谱绘制。
石斑鱼是广泛分布于印度洋、太平洋热带和亚热带海域的岩礁鱼类,也是我国重要的海水养殖经济鱼类。鞍带石斑鱼,俗名龙胆石斑、龙趸,是石斑鱼类中体型最大、生长最快的一种石斑鱼,具有抗病力强、生长快速、味道鲜美等特点,因而广泛应用于石斑鱼杂交育种和良种选育。
日前,在山东省农业良种工程等项目支持下,黄海水产研究所陈松林研究员团队、中山大学林浩然院士团队和美国密歇根州立大学李伟明教授团队等,联合完成了鞍带石斑鱼(龙胆石斑)的全基因组测序和基因组图谱绘制,并解析了其先天性免疫和快速生长的基因组学机制。该研究成果于6月22日在国际重要学术刊物《分子生态资源》上发表。
研究人员采用二代测序和HiC三维基因组技术,构建了染色体水平的鞍带石斑鱼基因组图谱,结果显示鞍带石斑鱼基因组大小为1.086Gb,含有24718个蛋白编码基因。分析显示,鞍带石斑鱼与三棘刺鱼关系最近,分化时间距今约1亿年,两者的部分染色体发生了融合或分裂；鞍带石斑鱼具有较完善的先天免疫系统,其中一些参与先天性免疫的基因家族发生了显著扩张,并发生了显著的DNA序列变化(正选择)。据介绍,鞍带石斑鱼基因组精细图谱的完成,为解析石斑鱼科鱼类生长、抗病等重要经济性状的分子机制奠定了重要基础。
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