成武港安济河作业区已开工建设，巨野港万丰作业区正在开展前期工作
牡丹晚报全媒体记者从市交通运输局了解到，根据2012年省政府、交通运输部批复的《山东省内河航道与港口布局规划》，在菏泽市境内将规划建设四条航道，分别是新万福河航道、郓城新河航道、洙水河航道和郓巨河航道。其中，南北走向的郓巨河航道由于跨越多条高速和铁路，难以实施，考虑在省内河航道规划调整时，替换为东鱼河航道。目前，洙水河航道已建成通航，新万福河复航工程正在建设中，郓城新河通航工程和新万福河复航二期工程正在开展前期工作。
根据省政府批复的《菏泽港总体规划（2015-2030）》，在规划期内菏泽港将形成以巨野港为核心港区，成武港、郓城港、定陶港为重要港区的“一港四区”总体发展格局，四个港区规划建设十一个作业区。目前，巨野港麒麟作业区已建成投入运营，成武港安济河作业区已开工建设，巨野港万丰作业区正在开展前期工作。
另外，在航道建设方面，郓城新河航道起点为郓城新河跨国道220大桥以东500米，向东经菏泽市郓城县、济宁市梁山县和嘉祥县，终点为梁济运河 （现为三级航道，已通航），全长24.5公里，其中菏泽段约10公里，计划按三级航道标准进行建设，改建部分桥梁，改建新庄闸为通航节制闸。该项目已完成部分前期工作。
新万福河复航二期工程跨越定陶、巨野、成武三个县区，起点为定陶连接线，终点与关桥枢纽衔接，全长35.3公里，计划按三级航道标准进行建设。该项目正处于前期工作阶段，在对航道梯级建设方案、补水方案等进行专题论证。
东鱼河航道工程涉及定陶、曹县、成武、单县和济宁金乡、鱼台等6个县区，主航道起点为京九铁路桥下游2公里处，终点为昭阳湖东鱼河河口段，全长109公里；工程还包括团结河、东鱼河北支、东沟河三条支线航道，合计65公里；拟按二级航道标准进行规划建设，目前正处于论证阶段。
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