全球首个花椒基因组测序取得初步成果

陕西农村报 2018-12-19 08:12 大字

本报讯(张建超 雷长民 报道)日前,韩城市花椒管理局联合深圳华大基因公司,经过近一年的时间,使用PacBio三代测序平台(80X)+二代测序(50X)对花椒基因组进行了成功的测序。

现有结果表明花椒基因组杂合率约为4.11%,大小约为5.13Gb,实际装出基因组大小5.08Gb,ContigN50为473Kb,基因组busco评估93.3%,共预测出基因62,983,基因busco评估92.9%,实现了花椒超高杂合、超高重复基因组的高质量组装。花椒种质资源丰富,栽培历史悠久,过去的研究主要集中在花椒生态习性、品种分类、生理生化等方面。花椒基因组测序成果将为花椒分子水平的研究提供良好的平台。

同时研究人员正在构建“全球首个花椒基因组数据库”,近期将面对所有花椒研究人员、花椒种植人员开放,将成为花椒产品科普、产业发展、推进研究整合的综合平台。

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