川农大中科院团队联手揭示水稻基因“隐藏”变异
本报讯（张喆 四川农村日报全媒体记者 杜铠兵）5月30日，记者从四川农业大学获悉，近日全球顶尖学术期刊 Cell在线发布了四川农业大学国家重点实验室、水稻研究所李仕贵与钦鹏教授团队联合中科院遗传与发育生物学研究所梁承志研究员团队完成的题为“基于33个水稻遗传多样性材料的泛基因组分析揭示‘隐藏’的基因组变异”的研究论文。
团队选取了具有高度代表性的33个水稻材料，采用最新的第三代基因测序技术，对其中31份材料进行了长片段测序、高质量基因组组装及基因注释。结合已报道的日本晴和蜀恢498两个材料的参考基因组，共鉴定到171072个基因结构性变异和 22549 个基因拷贝数变异。
这些基因组变异无法利用传统手段鉴定到，绝大多数在先前研究中均未发现，但在重要农艺性状调控中发挥重要作用，揭示这些结构性变异的方向对理解水稻的进化和驯化遗传基础也有重要意义。研究人员还首次构建了水稻图形基因组，是水稻中迄今最为完备的基于图形结构的泛基因组。
李仕贵教授表示，此研究通过打开结构性变异研究的大门，推进水稻高质量泛基因组研究，将为研究水稻等作物进化与驯化、基因组研究、种质资源的精准评价、优良基因的挖掘、基因功能解析等研究奠定坚实基础，有助于提升水稻功能基因组学和分子设计育种研究水平，为选育高产优质、绿色安全水稻新品种提供基础支撑。
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