多个涉计划生育司局取消
与原国家卫计委机构设置相比，国家卫健委内设机构有了较大的变动。
方案显示，国家卫健委下设21个内设机构，包括新设立的老龄健康司、职业健康司、人口监测与家庭发展司和保健局，原国家卫计委的内设机构计划生育基层指导司、计划生育家庭发展司、流动人口计划生育服务管理司被取消。
新设立的人口监测与家庭发展司负责承担人口监测预警工作并提出人口与家庭发展相关政策建议，完善生育政策并组织实施，建立和完善计划生育特殊家庭扶助制度。
老龄健康司负责组织拟订并协调落实应对老龄化的政策措施。组织拟订医养结合的政策、标准和规范，建立和完善老年健康服务体系。承担全国老龄工作委员会的具体工作。职业健康司负责拟订职业卫生、放射卫生相关政策、标准并组织实施。开展重点职业病监测、专项调查、职业健康风险评估和职业人群健康管理工作。协调开展职业病防治工作。
延续设置养老金会计部
在社保方面作出重大调整的部门涉及国家医疗保障局、全国社保基金理事会等单位。国家医疗保障局“三定”方案明确了其与国家卫生健康委员会的有关职责分工。国家卫生健康委员会、国家医疗保障局等部门在医疗、医保、医药等方面加强制度、政策衔接，建立沟通协商机制，协同推进改革，提高医疗资源使用效率和医疗保障水平。
全国社会保障基金理事会已明确作为基金投资运营机构，不明确行政级别。其职能包括管理运营全国社会保障基金；受国务院委托集中持有管理划转的中央企业国有股权；经国务院批准，受托管理基本养老保险基金投资运营；定期向社会公布基金收支、管理和投资运营情况等。
根据规定，全国社会保障基金理事会内设综合部、规划研究部、基金财务部、证券投资部、境外投资部、股权资产部、法规及监管部、风险管理部、养老金管理部、养老金会计部、信息技术部和机关党委（人事部）。
记者注意到，养老金管理部和养老金会计部都是2016年《全国社会保障基金条例》实施后，全国社保基金理事会为养老金投资运营而新设的部门。这一次“三定”方案，再次明确了这两个部门的设置。据《新京报》
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